现今，人们使用的各种牙膏，不论其用料殊异，在配方中都含有摩擦剂、发泡剂、温化剂、稠化剂、调味剂、防腐剂等，有些牙膏还含有氟化剂等。这些用剂中含有磷酸盐、碳酸钙、碳酸镁等化学物质。
医学界经过多年研究认为，如果刷牙后漱口不彻底，就会摄入牙膏残液，引起局部性胃肠炎，严重者会导致克隆病，该病的主要症状是腹痛、腹泻、腹部有肿块隆起，可伴有发热、营养障碍、关节炎等。这种病症的病因尚未彻底探明，因而无法根治。但已有迹象表明，过量吸入牙膏残液，可能是导致该病的原因之一。
特别是年幼的儿童，其抵抗力低，免疫功能尚不健全，口腔黏膜特别娇嫩，使用刺激性较强的牙膏会损伤儿童的口腔，再加上儿童不善于漱口清除牙膏残液，如果牙膏残液中过多的化学成分滞留在体内，会对儿童的生长发育和身体健康造成极大的危害。因此儿童漱口最好不用牙膏。
使用药物牙膏可以使一些牙病得到治疗。但是，若不对症选用药物牙膏，不仅不能达到预期的目的，而且还会有副作用。药物牙膏虽对一些口腔疾病有疗效，但并不能包治所有的口腔疾病。如果长期使用抗菌消炎类药物牙膏，会在杀灭致菌的同时将口腔中的正常细菌也杀灭了，使口腔产生新的疾患；许多药物牙膏中含有生物碱和刺激性物质，长期使用会损害口腔黏膜，使口腔、牙龈、舌头、口唇、咽喉等处发炎；有些带有苦辣味的药物牙膏长期使用会使人胃肠不适；有些药物牙膏含有一定量的色素，长期使用，可使牙齿失去光泽。因而家庭要经常换用不同品牌的牙膏。
